MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid A

Total Repeats: 6289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007410	ATA	2	6	269	274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812285
2	NC_007410	A	6	6	417	422	100 %	0 %	0 %	0 %	75812285
3	NC_007410	TC	3	6	478	483	0 %	50 %	0 %	50 %	75812285
4	NC_007410	TAAA	2	8	494	501	75 %	25 %	0 %	0 %	75812285
5	NC_007410	ACA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812285
6	NC_007410	AT	3	6	609	614	50 %	50 %	0 %	0 %	75812285
7	NC_007410	A	6	6	630	635	100 %	0 %	0 %	0 %	75812285
8	NC_007410	TTCT	2	8	645	652	0 %	75 %	0 %	25 %	75812285
9	NC_007410	CAA	3	9	718	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812285
10	NC_007410	AAT	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812285
11	NC_007410	TTC	2	6	814	819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812285
12	NC_007410	TCA	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812285
13	NC_007410	TAT	2	6	876	881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812285
14	NC_007410	TGG	2	6	894	899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812285
15	NC_007410	AATT	2	8	908	915	50 %	50 %	0 %	0 %	75812285
16	NC_007410	TG	3	6	984	989	0 %	50 %	50 %	0 %	75812285
17	NC_007410	T	6	6	1039	1044	0 %	100 %	0 %	0 %	75812285
18	NC_007410	AGTTA	2	10	1062	1071	40 %	40 %	20 %	0 %	75812285
19	NC_007410	ATG	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812285
20	NC_007410	AGT	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812285
21	NC_007410	ACT	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812285
22	NC_007410	ATT	2	6	1210	1215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812285
23	NC_007410	TTA	2	6	1244	1249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812285
24	NC_007410	AAG	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812285
25	NC_007410	T	6	6	1277	1282	0 %	100 %	0 %	0 %	75812285
26	NC_007410	TTTA	2	8	1361	1368	25 %	75 %	0 %	0 %	75812285
27	NC_007410	CTA	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812286
28	NC_007410	T	6	6	1481	1486	0 %	100 %	0 %	0 %	75812286
29	NC_007410	GGA	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812286
30	NC_007410	AAT	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812286
31	NC_007410	ATTC	2	8	1723	1730	25 %	50 %	0 %	25 %	75812286
32	NC_007410	GCT	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812286
33	NC_007410	GGC	2	6	1808	1813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812286
34	NC_007410	CTA	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812286
35	NC_007410	TGG	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812286
36	NC_007410	CGG	2	6	1989	1994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812286
37	NC_007410	GCA	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812286
38	NC_007410	CTG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812286
39	NC_007410	GTT	2	6	2044	2049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812286
40	NC_007410	TTA	2	6	2133	2138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812286
41	NC_007410	TCC	2	6	2247	2252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812286
42	NC_007410	TTC	2	6	2275	2280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812286
43	NC_007410	TGGAG	2	10	2445	2454	20 %	20 %	60 %	0 %	75812286
44	NC_007410	ATTAAC	2	12	2477	2488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812286
45	NC_007410	CTG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812286
46	NC_007410	CTG	2	6	2529	2534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812286
47	NC_007410	T	6	6	2594	2599	0 %	100 %	0 %	0 %	75812286
48	NC_007410	TAGTG	2	10	2625	2634	20 %	40 %	40 %	0 %	75812286
49	NC_007410	CAC	2	6	2671	2676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812286
50	NC_007410	TAAT	2	8	2680	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	75812286
51	NC_007410	AGC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812286
52	NC_007410	CTC	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812286
53	NC_007410	AAT	2	6	2914	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812286
54	NC_007410	CATTTA	2	12	2950	2961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812286
55	NC_007410	TTC	2	6	2990	2995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812286
56	NC_007410	CCT	2	6	3066	3071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812286
57	NC_007410	AGC	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812286
58	NC_007410	ATA	2	6	3139	3144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812286
59	NC_007410	GA	3	6	3157	3162	50 %	0 %	50 %	0 %	75812286
60	NC_007410	CCG	2	6	3828	3833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812287
61	NC_007410	CCG	2	6	3937	3942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812287
62	NC_007410	GCT	2	6	3957	3962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812287
63	NC_007410	ATC	2	6	3976	3981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812287
64	NC_007410	TAC	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812287
65	NC_007410	CTT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812287
66	NC_007410	GCC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812287
67	NC_007410	TCG	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812287
68	NC_007410	GCA	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812287
69	NC_007410	CT	4	8	4524	4531	0 %	50 %	0 %	50 %	75812287
70	NC_007410	TCC	2	6	4565	4570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812287
71	NC_007410	T	6	6	4685	4690	0 %	100 %	0 %	0 %	75812287
72	NC_007410	AGGT	2	8	4701	4708	25 %	25 %	50 %	0 %	75812287
73	NC_007410	A	6	6	5002	5007	100 %	0 %	0 %	0 %	75812288
74	NC_007410	A	6	6	5026	5031	100 %	0 %	0 %	0 %	75812288
75	NC_007410	TGC	2	6	5082	5087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812288
76	NC_007410	AC	3	6	5090	5095	50 %	0 %	0 %	50 %	75812288
77	NC_007410	AGC	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812288
78	NC_007410	TCC	2	6	5157	5162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812288
79	NC_007410	TGAT	2	8	5262	5269	25 %	50 %	25 %	0 %	75812288
80	NC_007410	ATC	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812289
81	NC_007410	TGG	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812289
82	NC_007410	T	6	6	6006	6011	0 %	100 %	0 %	0 %	75812289
83	NC_007410	ATA	3	9	6025	6033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812289
84	NC_007410	T	8	8	6041	6048	0 %	100 %	0 %	0 %	75812289
85	NC_007410	T	6	6	6104	6109	0 %	100 %	0 %	0 %	75812289
86	NC_007410	AGA	2	6	6179	6184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812289
87	NC_007410	ACAA	2	8	6215	6222	75 %	0 %	0 %	25 %	75812289
88	NC_007410	CAT	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812289
89	NC_007410	TCT	2	6	6255	6260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812289
90	NC_007410	T	6	6	6267	6272	0 %	100 %	0 %	0 %	75812289
91	NC_007410	TAC	2	6	6286	6291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812289
92	NC_007410	GCA	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812289
93	NC_007410	TC	3	6	6315	6320	0 %	50 %	0 %	50 %	75812289
94	NC_007410	CTG	2	6	6331	6336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812289
95	NC_007410	GAAA	2	8	6341	6348	75 %	0 %	25 %	0 %	75812289
96	NC_007410	TATTT	2	10	6469	6478	20 %	80 %	0 %	0 %	75812290
97	NC_007410	T	6	6	6490	6495	0 %	100 %	0 %	0 %	75812290
98	NC_007410	AAAT	2	8	6537	6544	75 %	25 %	0 %	0 %	75812290
99	NC_007410	ATA	2	6	6549	6554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812290
100	NC_007410	ATA	2	6	6564	6569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812290
101	NC_007410	GGC	2	6	6608	6613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812290
102	NC_007410	AGG	2	6	6622	6627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812290
103	NC_007410	ATTT	2	8	6630	6637	25 %	75 %	0 %	0 %	75812290
104	NC_007410	AATT	2	8	6658	6665	50 %	50 %	0 %	0 %	75812290
105	NC_007410	TAA	2	6	6685	6690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812290
106	NC_007410	TAT	2	6	6697	6702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812290
107	NC_007410	ATT	2	6	6710	6715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812290
108	NC_007410	ATTT	2	8	6780	6787	25 %	75 %	0 %	0 %	75812290
109	NC_007410	T	9	9	6806	6814	0 %	100 %	0 %	0 %	75812290
110	NC_007410	TGG	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812290
111	NC_007410	T	6	6	6847	6852	0 %	100 %	0 %	0 %	75812290
112	NC_007410	CTA	2	6	6855	6860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812290
113	NC_007410	ATA	2	6	6867	6872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812290
114	NC_007410	GA	3	6	6975	6980	50 %	0 %	50 %	0 %	75812290
115	NC_007410	ATA	2	6	7002	7007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812290
116	NC_007410	TTA	2	6	7038	7043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812290
117	NC_007410	TAG	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812290
118	NC_007410	G	6	6	7130	7135	0 %	0 %	100 %	0 %	75812290
119	NC_007410	AGC	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812290
120	NC_007410	AAT	2	6	7232	7237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812290
121	NC_007410	A	6	6	7267	7272	100 %	0 %	0 %	0 %	75812290
122	NC_007410	ATT	3	9	7276	7284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812290
123	NC_007410	ATC	2	6	7432	7437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812290
124	NC_007410	AT	3	6	7457	7462	50 %	50 %	0 %	0 %	75812290
125	NC_007410	ACT	3	9	7544	7552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812290
126	NC_007410	CTT	2	6	7620	7625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812290
127	NC_007410	TAA	2	6	7705	7710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812290
128	NC_007410	AGG	2	6	7765	7770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812290
129	NC_007410	ATTT	2	8	7773	7780	25 %	75 %	0 %	0 %	75812290
130	NC_007410	TGG	2	6	7810	7815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812290
131	NC_007410	AT	3	6	7887	7892	50 %	50 %	0 %	0 %	75812290
132	NC_007410	ATT	2	6	7906	7911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812290
133	NC_007410	TGG	2	6	7954	7959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812290
134	NC_007410	ATT	2	6	7988	7993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812290
135	NC_007410	GGA	2	6	8000	8005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75812290
136	NC_007410	AGT	2	6	8012	8017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812290
137	NC_007410	GTA	2	6	8078	8083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812290
138	NC_007410	TCA	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812290
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140	NC_007410	CCT	2	6	8177	8182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812290
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142	NC_007410	AT	3	6	8205	8210	50 %	50 %	0 %	0 %	75812290
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176	NC_007410	CAA	2	6	9673	9678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812291
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262	NC_007410	TTTTA	2	10	13159	13168	20 %	80 %	0 %	0 %	75812293
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268	NC_007410	ACTA	2	8	13303	13310	50 %	25 %	0 %	25 %	75812293
269	NC_007410	AT	3	6	13323	13328	50 %	50 %	0 %	0 %	75812293
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271	NC_007410	AAT	2	6	13387	13392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812293
272	NC_007410	A	6	6	13442	13447	100 %	0 %	0 %	0 %	75812293
273	NC_007410	T	7	7	13503	13509	0 %	100 %	0 %	0 %	75812293
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279	NC_007410	ATG	2	6	13813	13818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812293
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399	NC_007410	GCCTCT	2	12	20770	20781	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	75812295
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